国の航空事故調査委員会が導き出した公式結論は、尾部不適切修理に起因する圧力障壁の破損であった。機体を製造した米ボーイング社による過去の修理ミスが原因で、飛行中に圧力障壁が破裂し、垂直尾翼と油圧系統を破壊したというシナリオだ。だが、この「ボーイング社単独原因説」に対しては、発表直後から数多くの航空技術者や元パイロットから疑問が相次いだ。
圧力障壁が破壊された場合、客室内には猛烈な減圧が生じ、白い霧が立ち込めると同時に気温が急低下するはずである。しかし、生存者の証言や機内で撮影された写真を見る限り、急激な減圧現象が発生していた痕跡は見当たらない。政治的配慮や日米関係の外交的圧力が、真の原因追究よりも優先されたのではないかという疑念が晴れることはない。公式な調査報告書が示した筋書きには、いまなお説明のつかない矛盾がいくつも残されている。