自衛隊の最高指揮官が軍人（制服組自衛官）ではなく政治家である首相に委ねられている理由は、文民統制（シビリアンコントロール）の仕組みと理由に直結しています。
戦前の日本において、軍部が政治の統制を離れて独走し、国を破滅的な戦争へと導いた歴史的教訓があります。この反省から、民主主義国家として「武力組織は国民の代表である政治家（文民）が統制しなければならない」という絶対原則が確立されました。日本国憲法第66条第2項には「内閣総理大臣その他の国務大臣は、文民でなければならない」と定められており、現役の自衛官が内閣に入閣することは禁じられています。
シビリアンコントロールの真相は、単に軍人を排除することではありません。主権者である国民が選挙を通じて選んだ国会議員、その中から選出された首相と防衛大臣が武力組織の生殺与奪の権を握ることで、国民の意思に基づかない武力行使を構造的に防ぐ点にあります。首相が最高指揮権を持ち、国会がその行動を監視・承認するという二重三重のセーフガードが機能しています。
